【術中注意事項】
　　1.探針探查時不應加用暴力，避免造成假道，誤將內口及最深一段瘺管遺留，以致術后复發感染，重新形成瘺管。
　　2.如果找不到內口，可先切開探針已經探及的一段瘺管，然后在創面有美藍染色的部位，尋找內段瘺管的開口，繼續插入探針探查。也可用力擠壓瘺管，即可見少許膿液或美藍從內口溢出。還可用皮鉗夾住瘺管外口處及其管壁，向外牽拉与放松，在窺肛器下可見腸壁肛瘺附近形成一下陷區，這多為內口所在部位。
　　3.切開瘺管時，若遇見肛門括約肌，必須使切口方向与肌纖維垂直，不應斜切或同時切斷兩處，否則將發生大便失禁。
　　4.切開肛門前側位置較深的瘺管后，不宜作瘺管切除，因前側肛門括約肌比較薄弱，又無恥骨直腸肌支持，切除后不易對合，容易造成大便失禁。一旦切斷，應用2-0腸線將切斷的肌肉作疏松的8形縫合，以免回縮。
　　5.切除后側复雜肛瘺時，注意不要損傷尾骨直腸肌，以免肛管向前移位。
　　6.對結核性瘺管，術前抗結核藥物應用要合理。術中污染不明顯者，可在徹底切除瘺管結核組織后，用細不鏽鋼絲或尼龍線縫合傷口，消滅死腔。

【術后處理】
　　1.術后若有排尿困難，可皮下注射新斯的明0.5mg∼1.0mg，并在膀胱區放置寒熱墊或塞痛樂。術后12小時不能排尿者，應予導尿。
　　2.術后進無渣飲食，一日3次口服雅片酊，每次0.5ml，保持便秘2日。
　　3.術后2日更換敷料，每日用1︰5000高錳酸鉀溫水坐浴；大便后也要坐浴，換藥。
　　4.換藥時檢查傷口，務必使創面肉芽從基底部生長，直至愈合，防止橋狀愈合。
　　5.結核性瘺管切除后，應抗結核治療保持半年以上。